La ville est historiquement une ville communiste, notamment ancien fief de André Chêne. Marcelin Berthelot était un politicien communiste du loiret. Donc, c'est peut-être une explication. À noter que le site de la mairie utilise toujours régulièrement Marcelin Berthelot:
https://www.fleurylesaubrais.fr/actualite/travaux-de-requalification-du-giratoire-carrefour-des-rue-marcelin-berthelot-de-curembourg-et-de-montaran/

https://www.larep.fr/fleury-les-aubrais-45400/actualites/doit-on-ecrire-marcelin-ou-marcellin-berthelot-a-propos-de-cette-rue-a-cheval-sur-orleans-et-fleury-les-aubrais_14526233/

Historiquement, la rue était Marcelin Berthelot (où j'ai grandi).
Le changement observé (notamment récemment lors d'une visite) est difficile à expliquer. J'ai trouvé l'article dans la république du centre qui essaie d'expliquer.
Je n'ai pas de réponses sur le changement d'orthographe.