Нельзя ли тогда в приложении сделать проверку на наличие организации с таким же названием рядом. И если есть, то пусть появляется сообщение, что это дубликат или, что уже есть в базе. Не знаю, насколько это реализуемо, нечто похожее есть в mapcam при добавлении камер.
Частично проблема решается нажатием на здание и отображением уже имеющихся в здании организаций. Это, кстати, вообще должно быть по умолчанию.
Ну и как вариант - запрет добавления/редактирования при не обновленных картах.